Juan Pujol García sinh ngày 14 tháng 2 năm 1912 ở Barcelona, Tây Ban Nha trong một gia đình thuộc tầng lớp trung lưu. Ông là người con thứ ba trong tổng số bốn người con của ông Joan Pujol, chủ một nhà máy nhuộm có tiếng ở Barcelona, và bà Mercedes García Guijarro.[1] Năm bảy tuổi, ông theo học tại Trường nội trú Valldemia ở Mataró, cách Barcelona khoảng 32 km; nơi ông gắn bó trong suốt bốn năm tiếp theo. Học sinh chỉ được phép ra khỏi trường vào Chủ nhật nếu có khách đến thăm, vì vậy bố ông đã thường xuyên đến thăm ông vào Chủ nhật hàng tuần.[2] Năm 13 tuổi, Pujol nhập học trường được điều hành bởi một người bạn chơi bài của bố ông là Đức cha Josep, và là nơi ông theo học trong ba năm. Sau khi cãi nhau với một người giáo viên trong trường, ông đã quyết định bỏ học và làm việc trong một cửa hàng kim khí ở La Rambla. Pujol đã lảm nhiều công việc khác nhau trong suốt thời thanh niên của ông, từ việc học chăn nuôi ở Trường Gia cầm Hoàng gia Arenys de Mar và tham gia quản lý nhiều doanh nghiệp khác nhau, trong đó có cả rạp chiếu phim.[3][4]

Cha của ông qua đời vài tháng sau khi nền Đệ Nhị Cộng hòa Tây Ban Nha được thành lập vào năm 1931, trong khi Pujol đang hoàn thành chương trình học về nông dân chăn nuôi gia cầm. Nhà máy nhuộm được cha ông để lại đã giúp gia đình của Pujol có một cuộc sống ổn định, tới khi bị công nhân đình công đánh chiếm nhà máy trong giai đoạn đầu của Nội chiến Tây Ban Nha.[4][5]